Целью программы аспирантуры является подготовка аспирантом диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук в области экспериментальной ядерной физике, физики элементарных частиц и космологии, физики космических лучей. Аспирантам предлагается участие в экспериментах по физике элементарных частиц (BM@N и MPD на ускорителе НИКА, ОИЯИ; СПАСЧАРМ на ускорителе У-70, ИФВЭ НИЦ КИ; ATLAS, CMS, ALICE на ускорителе LHC, CERN; STAR на ускорителе RHIC, BNL), нейтринной физике (РЭД-100; Borexino, DarkSide), физике космических лучей (НЕВОД, Tunka, AMS-02) и гамма-астрономии (GAMMA-400), а также НИР по космологии и космомикрофизике и НИОКРах по использованию методов ядерной физики в прикладных задачах (к примеру, дефектоскопии), а также в работах по различным грантам РНФ и государственных заданиях по тематике фундаментальных и прикладных исследований по тематикам выпускающих подразделений.